Graphormer部署教程Supervisor开机自启日志监控服务管理一文搞定1. 项目概述Graphormer是一种基于纯Transformer架构的图神经网络专门为分子图原子-键结构的全局结构建模与属性预测而设计。该模型在OGB、PCQM4M等分子基准测试中表现出色大幅超越了传统GNN方法。核心信息模型名称microsoft/Graphormer (Distributional-Graphormer)版本property-guided checkpoint模型大小3.7GB部署日期2026-03-272. 模型基础信息2.1 模型规格项目值模型类型分子属性预测 (Molecular Property Prediction)主要用途药物发现、材料科学、分子建模输入格式SMILES 分子结构支持任务catalyst-adsorption, property-guided2.2 功能特点分子属性预测根据分子结构预测化学性质药物发现帮助识别潜在药物分子材料科学预测材料分子特性图神经网络基于分子图结构进行预测3. 环境准备与部署3.1 系统要求操作系统Linux (推荐Ubuntu 20.04)Python环境Miniconda (Python 3.11)GPUNVIDIA GPU (推荐RTX 4090 24GB)存储空间至少10GB可用空间3.2 依赖安装conda create -n torch28 python3.11 conda activate torch28 pip install rdkit-pypi torch-geometric ogb gradio torch2.8.04. Supervisor服务配置4.1 安装Supervisorsudo apt-get update sudo apt-get install supervisor4.2 创建配置文件编辑/etc/supervisor/conf.d/graphormer.conf[program:graphormer] command/root/miniconda3/envs/torch28/bin/python /root/graphormer/app.py directory/root/graphormer userroot autostarttrue autorestarttrue stderr_logfile/root/logs/graphormer_error.log stdout_logfile/root/logs/graphormer.log environmentPYTHONPATH/root/graphormer4.3 应用配置并启动sudo supervisorctl reread sudo supervisorctl update sudo supervisorctl start graphormer5. 服务管理命令5.1 基本操作# 查看服务状态 supervisorctl status graphormer # 启动服务 supervisorctl start graphormer # 停止服务 supervisorctl stop graphormer # 重启服务 supervisorctl restart graphormer5.2 日志监控# 实时查看日志 tail -f /root/logs/graphormer.log # 查看错误日志 tail -f /root/logs/graphormer_error.log6. 文件路径说明内容路径主程序/root/graphormer/app.py日志文件/root/logs/graphormer.log错误日志/root/logs/graphormer_error.log模型文件/root/ai-models/microsoft/Graphormer/Supervisor配置/etc/supervisor/conf.d/graphormer.conf7. 使用指南7.1 访问服务服务运行在端口7860通过浏览器访问http://服务器IP地址:78607.2 预测步骤输入分子SMILES在输入框中输入有效的分子结构选择预测任务property-guided分子属性预测catalyst-adsorption催化剂吸附预测点击预测获取预测结果7.3 SMILES示例分子SMILES乙醇CCO苯c1ccccc1乙酸CC(O)O甲烷C水O甲醛CO8. 常见问题解决8.1 服务状态显示STARTING这是正常现象模型首次加载可能需要几分钟时间。等待状态变为RUNNING即可。8.2 显存不足问题Graphormer模型仅需3.7GB显存RTX 4090 24GB完全足够运行。如遇问题检查是否有其他进程占用显存尝试重启服务8.3 端口无法访问检查防火墙设置sudo ufw status确认端口已开放sudo ufw allow 7860检查服务是否正常运行supervisorctl status graphormer9. 技术栈说明分子处理RDKit图神经网络PyTorch GeometricWeb界面Gradio 6.10.0Python环境3.11 (miniconda torch28环境)深度学习框架PyTorch 2.8.010. 总结本教程详细介绍了Graphormer分子属性预测模型的完整部署流程重点包括Supervisor配置实现服务管理、开机自启和日志监控服务管理命令启动、停止、重启和状态查看使用指南分子SMILES输入和预测任务选择问题排查常见问题的解决方法通过这套方案您可以轻松实现Graphormer模型的稳定运行和高效管理为药物发现和材料科学研究提供有力支持。获取更多AI镜像想探索更多AI镜像和应用场景访问 CSDN星图镜像广场提供丰富的预置镜像覆盖大模型推理、图像生成、视频生成、模型微调等多个领域支持一键部署。