支持6种语言!基因表达+拷贝数变异分析
摘要定量聚合酶链反应qPCR是临床生物化学实验室开展基因表达分析与拷贝数变异CNV检测的核心技术。但qPCR数据的完整解读包括数据标准化、严谨统计检验与专业可视化通常要求使用者具备专业生物信息学能力。本研究旨在开发款易用的网页平台整合完善的统计分析框架与质量控制模块实现qPCR数据的标准化、流程化分析。该工具基于Python与Streamlit框架开发支持手动输入、电子表格导入以及RDML/RDES标准格式文件导入靶基因与内参基因的Cq值可自动计算ΔCq、ΔΔCq值并采用2^(-ΔΔCq)法计算相对表达量。平台内置多内参基因标准化geNorm算法、自动异常值检测Grubbs检验或分位距法与扩增效率校正Pfaffl模型功能并会对ΔCt值执行正态性检验Shapiro-Wilk法与方差齐性检验Levene法保障统计分析的有效性。平台搭载自动化统计决策流程Shapiro-Wilk检验→ Levene检验→ t检验/Welch检验/Mann-Whitney U检验/方差分析/Kruskal-Wallis检验同时支持Bonferroni校正与Benjamini-Hochberg错误发现率FDR校正界面支持土耳其语、英语、德语、法语、西班牙语、阿拉伯语6种语言适配全球用户使用。研究通过7组预设测试场景将平台计算结果与Excel手动计算结果比对验证所有场景下结果均完全一致。GeneQuantify提供了高易用性、集成化的qPCR分析环境整合了自动计算、质量控制、统计决策与可视化功能。该平台遵循MIQE指南采用基于相对定量值RQ的自动化统计检验选择策略可提升分子研究、临床生化检验与教学场景下分析的可重复性、透明度与工作效率。网址https://GeneQuantify.streamlit.app/源代码https://github.com/burhanetty/GeneQuantifyburhanettin.yalcinkayatubitak.gov.tr#定量聚合酶链反应 #qPCR #基因表达 #拷贝数变异 #CNV #网页工具 #geNorm算法 #实时荧光定量PCR实验最低信息标准 #MIQE #统计自动化 #相对定量材料与方法应用开发与技术框架图1GeneQuantify网页工具工作流程图统计分析流程图2统计检验决策流程结果表1验证场景与检验结果汇总表2 GeneQuantify与现有网页版qPCR分析工具的功能对比详细总结思维导图自动化统计决策流程与现有工具的比较参考Mol Cell Biochem. 2026 Jul 1. doi: 10.1007/s11010-026-05621-y.GeneQuantify: a web-based tool for qPCR gene expression and copy number variation analysis注AI辅助创作如有不当欢迎指出。内容仅供参考不构成任何建议。