阿尔茨海默病研究正在从“看见病理沉积”进入“理解病理微环境”的阶段。Aβ斑块、神经元损伤、星形胶质细胞反应和小胶质细胞活化并不是孤立事件而是发生在同一张脑组织切片中的连续过程。PCF80作为基于80抗体Panel的空间单细胞蛋白组旗舰版适合在组织原位同时解析细胞身份、功能状态、空间位置、邻近关系和组织微环境全景。近期《Nature Neuroscience》上发表了一篇题为“Spatial proteomic analysis in human Alzheimer’s disease brains enables identification of microenvironment-dependent microglial cell states”的研究聚焦人类AD脑组织研究团队优化CODEXPCF空间单细胞蛋白组流程建立面向中枢神经系统样本的CODEX-CNS方案。文献指出团队在FFPE额叶皮质样本中设置覆盖神经元、星形胶质细胞、少突胶质细胞、小胶质细胞、血管结构及Aβ病理的抗体Panel并结合空间成像与分析流程描绘AD脑内小胶质细胞状态。研究关注的不是单一marker升高而是Aβ斑块周围到底聚集了哪些细胞、这些细胞呈现怎样的蛋白表型、形态是否改变以及它们与星形胶质细胞、血管和神经元损伤之间是否形成特定邻域。PCF80可以沿着这类研究思路进一步深入。相比只观察少数免疫或神经标志物80抗体Panel能够把细胞分型、活化/吞噬相关状态、胶质反应、血管结构和病理相关蛋白放在同一套空间框架中分析。例如在AD研究中研究者不仅关心小胶质细胞是否表达IBA1、TMEM119、CD68、CD163、HLA-DR等指标也关心这些细胞是否靠近致密Aβ斑块、是否与GFAP高表达的星形胶质细胞相邻、是否分布在血管附近以及是否位于突触标志物减少或神经元损伤增强的区域。PCF80的价值在于用空间蛋白组方式把这些维度统一起来。PCF80适用于多类AD和神经退行性疾病相关研究一是脑组织不同区域的细胞组成与微环境差异分析例如灰质、白质、血管周围区域或斑块周边区域二是小胶质细胞和巨噬细胞样细胞的蛋白表型分型进一步比较稳态、活化、吞噬、抗原呈递等状态三是Aβ斑块、反应性星形胶质细胞和神经元损伤之间的空间邻域研究四是不同病程、不同病理负荷或不同样本来源之间的微环境比较。对于已经有单细胞测序、空间转录组或常规免疫染色结果的团队PCF80还可以作为补充空间蛋白证据的工具。总体来看这篇文献提示我们AD脑组织不是简单的“斑块堆积场”而是由神经元、胶质细胞、血管和病理沉积共同构成的复杂生态系统。PCF80并不应被表述为诊断或治疗工具而应被定位为面向科研场景的组织原位空间蛋白分析方案。它能够帮助研究者在同一张切片中更系统地回答小胶质细胞处于什么状态、它们围绕什么结构分布、与哪些细胞相邻、局部微环境是否出现可重复的空间模式。对于希望从组织层面理解AD免疫机制的科研人员PCF80提供的是一种更接近真实病理场景的观察路径。参考文献Sanchez-Molina, P., Rosmus, DD., Brownell, D. et al. Spatial proteomic analysis in human Alzheimer’s disease brains enables identification of microenvironment-dependent microglial cell states. Nat Neurosci (2026). https://doi.org/10.1038/s41593-026-02267-3